统计显示，在上海市质子重离子医院9年来收治的全部患者中，头颈部肿瘤3528例（包括鼻咽癌、颅内颅底肿瘤、咽喉及颈部肿瘤、鼻腔及鼻窦肿瘤等）、胸部肿瘤1166例（包括肺癌、食管癌、纵隔肿瘤、胸腺肿瘤等）、腹盆腔及其他部位肿瘤2102例（包括前列腺癌、肝癌、胰腺癌、乳腺癌、盆腔及四肢肿瘤等）。其中，“5+2”重点病种（鼻咽癌、颅内颅底肿瘤、肺癌、肝癌、前列腺癌，胰腺癌、乳腺癌）患者数占总数的四分之三。
再以鼻咽癌为例，该院已治疗并随访鼻咽癌1346例。其中，初治鼻咽癌患者5年生存率达91.2%1629:com，优于光子放疗的85%，且治疗期间未见3-4级口腔粘膜反应。医院在国际上首创采用单纯重离子治疗局部复发鼻咽癌，相较于光子放疗，患者5年生存率自不足30%提升至42.7%，鼻咽黏膜坏死发生率自40%降低至16.9%。相关研究成果在国际粒子治疗协作委员会（PTCOG）第61届年会上，荣获唯一的Michael Goitein最佳临床摘要奖，受到国际同行的一致认可。
上海市质子重离子医院副院长张波表示，面对国内粒子中心建设热潮，医院主动对接国家战略需求，创新开展院校深度融合的“订单式”复合人才培育，依托复旦大学开创并连续推进10批次87名放射物理生物医学工程硕士培养。同时，医院创建了国内首个粒子放射物理师在职培养和再教育课程体系，已为来自甘肃、山东、福建、广东等十余个省份的110余位专业人员开展培训1629:com，为国内粒子放疗事业的推广和发展奠定人才基础。
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